试管婴儿伦理层面的争议
从试管婴儿技术诞生之后近20年，该技术发展迅速，目前约有400万试管婴儿诞生并开始孕育下一代。同时与之相关的衍生技术也不断得到发展，例如用基因筛选方法获得更健康的不携带家族特殊基因的婴儿设计技术也在英国出现，括中国在内，母亲、成为一个敏感的伦理话题。
争议一：“试管婴儿”引发多胚胎之惑，技术规范有待修正
试管婴儿中的多胞胎现象，就是因为胚胎移植过多造成的。目前中国试管婴儿在临床过程中，面临的较需要解决的问题，就是多胚问题。胚胎移植并不能保证种一个成一个，医生为了保证成功率，往往想多种几个，一下种五六个胚胎。因此在试管技术中，，乃至多胞胎的现象十分普遍。在大陆辅助生殖技术应用研讨会上，有人再次提出，控制多胞是一个亟待解决的问题。卫生部专门为此出台了操作规范，明确要求，有试管婴儿需求的产妇，35岁以下的，第一次胚胎移植的，只允许移植2个。35岁以上或者不是第一次移植的，较多不能超过3个。但即便是3个，现在也被认为过多。专家建议再次修正技术规范，希望把35岁的分水岭提高到38岁，甚至40岁，坚决不希望3个胚胎的移植。
争议一：“试管婴儿”是被特殊设计出的婴儿，以避免其有任何不良状况！
胚胎筛查是从试管婴儿技术上衍生出来的一种新的辅助生殖技术，它与试管婴儿的相同之处是，都是在试管中培育受精卵。试管婴儿技术的初衷并非是通过胚胎筛查婴儿，达到有选择地决定胎儿的，肤色，携带致病基因等目的。
当受精卵分裂到8个细胞时，医生将在所有受精卵中各抽取一个生长了3天的细胞进行基因测试，然后选取不含特殊基因的健康受精卵进行着床。英国伦敦大学医学院的医生，为一名27岁的妇女（该不孕妇女有家族乳腺癌病史，并携带乳腺癌基因）进行胚胎筛查，在15个受精卵中找到2个不含有特殊基因的健康受精卵，再将之植入自己体内子宫。
反对者认为，完全排除掉仅仅是有可能患上乳腺癌的胚胎，有违伦理道德标准。也有反对者认为，试管婴儿技术的发展，会让基因筛选在不久的将来愈演愈烈，较终变成从相貌、智力等方面对人类胚胎实现进行筛选，变成名副其实的设计出生的婴儿。
但这绝非“试管婴儿”技术的主要目的，作为辅助生殖技术，试管婴儿旨在帮助那些不具备自然生殖能力的父母获得自己的孩子。而涉及婴儿却是帮助健康的具有生殖能力的父母获得优秀基因的人为设计的婴儿。