输卵管积水不处理而直接进行试管婴儿会影响试管的成功率，主要原因是输卵管内的积水会将宫腔内的胚胎排出体外，或是积水内含有有毒物质，可能影响胚胎成长，以致成功率下降。临床上也发现，输卵管积水的病人在怀孕后，自然流产的几率也会增加。