男科诊疗中心下设男性健康门诊及男科专家门诊,并建有男科检查室,男科实验室,男科手术室等。北京大学第三医院泌尿外科于八十年代建立男科,后扩大为男科诊疗中心。目前是全国门诊量最大的男科诊疗中心,年门诊量约十二万人次,是中华医学会男科学分会主任委员所在单位,在全国的男科学术界具有重要的影响力。
男科诊疗中心的诊疗范围为男性不育;男性性功能障碍;性传播疾病;前列腺疾病及其它男性生殖系疾病等。在以上各个方面,男性病专科拥有丰富的临床经验,先进的实验室设备,能开展多项男性生育能力检测的实验,在全国学术界有重要影响。
近几年来还陆续开展了精细度极高的显微外科技术:睾丸切开显微取精术、针对输精管梗阻的显微外科复通手术、男性殖器显微外科矫正手术、射精管梗阻电切术、精索静脉曲张显微外科结扎术等,在国内居领先地位。

该医院医生经验丰富,如姜辉,现为北京大学第三医院泌尿外科副主任,医学博士,男科诊疗中心负责人。专业特长:长期从事泌尿男科疾病的诊断和治疗,尤其对性功能障碍、男性不育、前列腺炎、前列腺增生和中老年男子雄激素缺乏综合症等疾病的诊治具有一定的研究和探索。