试管婴儿做宫腔镜，对接受试管婴儿的女性而言，痛苦毋宁是必然的。宫腔镜程序虽然只需要几小时，但这段时间会给受试者带来极大的痛苦感受。由于宫腔镜的程序要插入宫颈口，这使得大部分受试者会感到剧烈的疼痛，尤其是当棒形探头碰到宫颈口时，受试者会感到更加强烈的疼痛感。此外由于宫腔镜程序需要宫腔内登记，大多数受试者会感觉到很大的憋气，伴随着剧烈的疼痛感。这就要求受试者必须保持良好的抗压能力，才能在宫腔镜程序中保持平静。
由于宫腔镜程序会对受试者造成严重的痛苦感，因此女性接受试管婴儿手术时会有一定程度上的痛苦。但是宫腔镜技术有助于检查和确认患者乳头内是否存在异常情况，以及通过在宫腔内放置试管婴儿可以检查卵巢功能，改善胚胎形态和减少胎停育的风险，所以也是一种必须的过程。
试管婴儿做宫腔镜时痛苦是可以避免的。 宫腔镜只是一种检查，不需要切除任何组织，不要求外科手术，因此通常不需要麻醉。 但是当检查完成后，可能会有不适感，如微观牵痛或痉挛。 例如检查者可能会插入宫腔镜的腔内，以检查宫腔，以及使用气缩把器会带来压迫感，可能会出现轻微的痉挛或中等程度的伤害。 因此虽然宫腔镜没有痛苦，但可能会有轻微的不适感。
为了预防宫腔镜造成的不适，医生和护士可以在治疗过程中采取一些措施。 例如护士可以给予镇痛剂，以削减宫腔镜带来的挤压感，这样可以减少不适症状。 护士和医生也可以提供安抚的对话，舒缓处方检查的焦虑情绪，一起减轻痉挛症状。